一、溫州醫(yī)學(xué)院基因組醫(yī)學(xué)研究院簡介
根據(jù)國家戰(zhàn)略需求和國際學(xué)科的發(fā)展趨勢,溫州醫(yī)學(xué)院于2009年3月22日成立了基因組醫(yī)學(xué)研究院(genomics.wzmc.edu.cn),旨在從功能基因組和表觀基因組水平上研究復(fù)雜疾病發(fā)生發(fā)展的遺傳基礎(chǔ)和表觀遺傳機制,以及在疾病形成過程中,遺傳和環(huán)境之間的交互作用,以期為提高我國疾病防控能力、提高人民健康水平、促進(jìn)醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展做出基礎(chǔ)性、戰(zhàn)略性和前瞻性的貢獻(xiàn)。本院將依托于有良好樣本資源、病理診斷技術(shù)先進(jìn)的溫州醫(yī)學(xué)院及其附屬醫(yī)院,有效地整合并擴大溫州醫(yī)學(xué)院現(xiàn)有的疾病樣本資源,建立起國內(nèi)一流的生物樣本收集庫,并對這些樣本進(jìn)行深入、全面地全基因組相關(guān)分析和表觀基因組學(xué)分析,建立起基于學(xué)校,面向全國開放的功能基因篩選平臺、表觀遺傳學(xué)平臺、轉(zhuǎn)基因模式動物構(gòu)建平臺。并且,我們研究院借助新一代高通量測序技術(shù),開展全基因組(包括基因組、轉(zhuǎn)錄組、microRNA、DNA甲基化)相關(guān)生物信息學(xué)分析和深入挖掘,已經(jīng)在國際著名期刊發(fā)布論文(生物信息學(xué)軟件、webserver以及數(shù)據(jù)庫)數(shù)篇。正準(zhǔn)備搭建全基因組相關(guān)信息分析的整合平臺,為基因組信息全面、準(zhǔn)確、方便以及系統(tǒng)的分析打下基礎(chǔ),為人類基因組的臨床應(yīng)用提供工具支持和技術(shù)保障。基因組醫(yī)學(xué)研究院實行開放的、與國際接軌的管理體制和運行模式,加強與國內(nèi)外大學(xué)及研究中心的合作,力爭建設(shè)成為能夠承擔(dān)國家重大科研任務(wù)和國際合作項目的重要技術(shù)支撐平臺!
孫中生博士,溫州醫(yī)學(xué)院基因組醫(yī)學(xué)研究院院長。1982年于北京大學(xué)獲得學(xué)士學(xué)位,1992年于美國德克薩斯州A&M大學(xué)獲得博士學(xué)位,1993-1994年在德克薩斯州大學(xué)安德生癌癥研究中心從事博士后研究,1994-1998年在美國貝勒醫(yī)學(xué)院分子人類遺傳學(xué)系從事博士后研究,1998-1999年任路易斯安那州立大學(xué)神經(jīng)學(xué)中心助理教授、主任助理,并任生物化學(xué)和遺傳系助理教授,1999-2005年任美國康奈爾大學(xué)助理教授、威爾醫(yī)學(xué)院特護(hù)醫(yī)學(xué)實驗室主任醫(yī)學(xué),全 在線.提 供bhskgw.cn。主要研究方向為外周組織振蕩器的生物鐘基因在生理節(jié)律不同階段的特定表達(dá);免疫生理節(jié)奏的分子機制;研究生物鐘基因mPer2如何調(diào)節(jié)學(xué)習(xí)和記憶行為。孫中生博士發(fā)現(xiàn)了哺乳動物關(guān)鍵的生物鐘基因—mPer1和mPer2,該發(fā)現(xiàn)揭示了哺乳動物生物鐘的分子生物學(xué)基礎(chǔ),文章發(fā)表國際權(quán)威的《CELL》雜志上,并被《Science》評為1997年度十大科學(xué)突破。到目前為止,發(fā)表的十三篇生物學(xué)方面的研究論文,被他人引用了1400多次。近幾年開始從事表觀基因組學(xué)研究,成功預(yù)測了基因組上所有的DNA甲基化功能區(qū)序列,運用自主研發(fā)的9K CGI芯片對惡性腫瘤、出生缺陷等疾病進(jìn)行了大規(guī)模的DNA甲基化修飾研究,并且運用9K CGI芯片和Bisulfite測序?qū)Σ煌募谆疍NA富集技術(shù)進(jìn)行了系統(tǒng)的評價。
吳金雨博士,溫州醫(yī)學(xué)院基因組醫(yī)學(xué)研究院研究組長(PI)。吳金雨博士長期從事基因組信息學(xué)研究,迄今已在已在Nucleic Acid Research、Bioinformatics、BMC Bioinformatics、BMC Genomics和Genomics等國際權(quán)威雜志以第一作者或通訊作者身份發(fā)表SCI論文20余篇,并曾多次被Nucleic Acid Research,Bioinformatics,Journal of Molecular Evolution和PLoS ONE等雜志邀請作為其審稿人。已經(jīng)成功開發(fā)了一系列高度整合的比較基因組學(xué)分析平臺,包括proTF,ArchaeaTF,cTFbase,PlasmoGF和FlyPhy等。隨著新一代測序技術(shù)應(yīng)用的不斷拓展和帶來的機遇和挑戰(zhàn),已經(jīng)成功開發(fā)了新一代測序數(shù)據(jù)分析工具PGA4genomics,mirTools,MagicViewer,SplicingViewer,Exome-assistant,RRBS-analyser,mirTools 2.0,iMethy等。