南京醫(yī)科大學第四臨床醫(yī)學院淵源于 “江蘇醫(yī)學院”1953年成立的兒科學教研組。同年，開始招收兒科學五年制本科生。1959年12月成立兒科系。1962年起始招收三年制碩士研究生。1981年“兒科學”被國務院首批批準為碩士學位授予點，1986年又被批準為博士學位授予點。1994年“兒科學”被江蘇省政府評為省級重點學科。1999年又被國家教委授予“兒科學博士后流動站”。1999年7月，撤消兒科系，成立第二臨床醫(yī)學院。
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2007年1月，為優(yōu)化整合臨床教育資源，提高辦學效益，在原第二臨床醫(yī)學院的基礎上，新組建第四臨床醫(yī)學院，其構成為“四院一所”，即附屬腦科醫(yī)院、附屬南京兒童醫(yī)院、附屬南京婦幼保健院、南京醫(yī)科大學眼科醫(yī)院及兒科醫(yī)學研究所。其中有三所三級甲等醫(yī)院，學科力量較強，兒科學為江蘇省重點學科，神經病學、精神病與精神衛(wèi)生學、小兒心胸外科為校級重點學科。兒科學、神經病學為博士點，精神衛(wèi)生學、應用心理學為碩士點。兒科醫(yī)學研究所下設兒童保健、小兒腎臟病兩個研究中心，兒童營養(yǎng)、小兒腎臟病的相關研究處于國內一流水平，為保持專業(yè)特色打下了良好基礎。學院下設臨床醫(yī)學專業(yè)中的四個專業(yè)方向，即兒科醫(yī)學、精神醫(yī)學、生殖醫(yī)學、眼視光。
學院現(xiàn)有教研室15個,博士生導師4人，碩士生導師47人，教授15人，副教授48人，研究生97人，七年制學生147人，本科生458人，畢業(yè)生總數1423人，整體就業(yè)率達96.7%。
