公元220年曹丕襲魏王位，當年廢漢獻帝自立，國號魏。公元221年，劉備在成都稱帝，國號“漢”（史稱“蜀漢”或“蜀”)，據(jù)長江上游地區(qū)；222年孫權(quán)在建業(yè)（今南京市)稱吳王（229年稱帝)，據(jù)長江中下游及其以南地區(qū)。從此，魏、蜀、吳鼎立局面形成。三國連年征戰(zhàn)，263年魏滅蜀，265年司馬炎代魂立晉（吏稱西晉)，280年晉滅吳，全國復歸一統(tǒng)。但西晉王朝因司馬氏宗室爭奪中央統(tǒng)bhskgw.cn/sanji/治權(quán)，“八王之亂”持續(xù)十六年的混戰(zhàn)，使隱伏矛盾迅速激化，很快導致北方少數(shù)民族兵進中原。從316年匈奴貴族建立的政權(quán)滅西晉起，北方從此進入“五胡十六國”的戰(zhàn)亂時期，前后出現(xiàn)20個割據(jù)政權(quán)。直到公元439年鮮卑族政權(quán)北魏統(tǒng)一中國北方，方獲近百年的相對穩(wěn)定。534年北魏分裂為東魏和西魏，繼之北齊代東魏，北周代西魏，581年隋代北周。在南方，公元317年西晉瑯玡王司馬睿在建康（南京市)稱帝建立偏安江南的政權(quán)，史稱東晉。公元420年以后又歷經(jīng)宋（420～479年)、齊（479～502年)、梁（502～557年)、陳（557～589)四朝更迭。此四朝與北魏以降的北方政權(quán)相對峙，是為南北朝，直到公元589年隋滅陳，才再次結(jié)束割據(jù)局面，使全國重歸統(tǒng)一。
從東漢末年到隋統(tǒng)一全國近400年間，是中國社會發(fā)展歷程中最紛亂的時期之一，這個時期也是中國各民族大融合的一個時期，促進了經(jīng)濟文化的交流。在北方和長江上游地區(qū)，先后有曹魏和蜀漢分別制定魏律和漢律、推行屯田制；西晉初期改立占田制、課田制以及對王公官員的限田制，這對抑制土地兼并、補救戰(zhàn)爭創(chuàng)傷和恢復社會經(jīng)濟均有一定積極作用。北魏改變鮮卑族風俗、服制、語言，鼓勵與漢族通婚，加強同漢人士族的聯(lián)合統(tǒng)治。這些改革推進了民族融合，加快了各民族封建化進程，促進了北方生產(chǎn)、經(jīng)濟的恢復和科學文化的發(fā)展。
東晉和南朝時期，江南地區(qū)的生產(chǎn)有較為迅速的發(fā)展。西晉末開始的bhskgw.cn/zhuyuan/北方戰(zhàn)亂，迫使大量漢族農(nóng)民遷至相對安定的江南地區(qū)，總數(shù)達70萬人。北方先進的生產(chǎn)工具和生產(chǎn)技術被帶到南方，廣為傳播，使江南火耕水耨的粗放耕作狀態(tài)大為改變。農(nóng)作物品種逐步增加，牛耕普遍推行，干旱地區(qū)采用了北方精耕細作的區(qū)種法。同時，還興建了不少水利灌溉工程，創(chuàng)造了多種作物經(jīng)營，使農(nóng)業(yè)生產(chǎn)水平迅速提高，并帶動了手工業(yè)的發(fā)展，促進了商業(yè)的繁榮，生產(chǎn)和經(jīng)濟的恢復發(fā)展，促進了科學文化的發(fā)展。
在意識形態(tài)方面，隨fo教興起和道教流行，兩漢時期的獨尊儒學局面被打破了，開始出現(xiàn)儒fo道并立格局，并有玄學的流行。
fo教自西漢末由印度傳入我國，到東漢時已有人翻譯fo經(jīng)，但信fo者不多，魏晉時期印度和西域僧人陸續(xù)來到中國，隨著fo經(jīng)翻譯增加和fo寺興建，fo教迅速傳播，印度醫(yī)學也隨之傳入我國。南北朝時期大力提倡fo教，于是造fo寺、塑fo像、釋fo經(jīng)、傳fo學形成高潮。以至“招提櫛比，fo塔駢羅”，僧尼人數(shù)也大量增加。fo教教義將現(xiàn)實痛苦歸罪于前世不行善，要人們?nèi)淌芙袷揽嚯y，寄希望于來世，這種思想易為當時處于戰(zhàn)亂動蕩社會之中的人們所接受，“因果報應”、“靈魂不滅”、“三世輪回”等fo教迷信思想一時廣為傳播，勞動人民深受其害，文人和士大夫也以說fo談禪為能事。這在很大程度上渙散了人們同疾病作斗爭的意志，懈怠了人們創(chuàng)新醫(yī)藥的積極性，給醫(yī)學的發(fā)展帶來危害。
道教源于我國民間，東晉和南北朝時期道教教義理論和宗教組織迅速發(fā)展，形成一派很有影響的宗教勢力，其根本教義在于追求長生不老，還宣揚“讖緯”之說和“清靜虛無”等觀點。這些宗教迷信和無所作為的思想，無疑對社會和醫(yī)學的發(fā)展都產(chǎn)生消極影響，但是道術中有不少與醫(yī)藥保健有關的養(yǎng)生學內(nèi)容，煉丹過程也積累了豐富的化學和藥物學知識，為道教典籍和相關書籍所保存。
兩漢時期，統(tǒng)治階級所獨尊的儒家學說，此時期因fo教和道教的興盛受到很大沖擊，但仍是封建統(tǒng)治的基本思想柱石。儒經(jīng)所講倫理道德和禮樂制度等，對醫(yī)家均有較大影響，東晉以后，出于統(tǒng)治者的需要與提倡，儒、fo、道三家均有較大發(fā)展，漸成并立局面。
南朝時梁武帝肖衍為協(xié)調(diào)儒、fo、道關系，創(chuàng)三教同源說，試圖以fo教為主，儒道為輔統(tǒng)一三家。他首先興儒家，制禮樂，倡經(jīng)學，為孔子立廟，設五經(jīng)館，置五經(jīng)博士；又大興fo教，建fo寺達700所，親自講演fo經(jīng)，使fo教在南朝迅速發(fā)展，同時寵任道教徒陶弘景，賜以黃金、朱砂、曾青、雄黃等煉制仙丹，企求長生不死，致道教在南方濱海各地大為得勢。于是形成了南北朝時期儒、fo、道相互鼎峙的錯綜復雜局面。
《易經(jīng)》、《老子》、《莊子》被稱為“三玄”，玄學家熔儒家的名稱與“道家”的“自然”為一體，加以改造和發(fā)揮，被稱為玄學，它是這時期的一個重要的哲學思想體系。他們自恃清高、無為、清談“玄理”。其思想體系甚為復雜，相當部分士人，放蕩不羈，講求服石、煉丹，在這一過程中發(fā)現(xiàn)和積累許多化學變化的規(guī)律和經(jīng)驗，從另一側(cè)面推動醫(yī)藥學的發(fā)展。
一、此期醫(yī)學發(fā)展有三個特點
（一)人民群眾和許多醫(yī)家面對戰(zhàn)爭連綿，社會動蕩局面，以及民族融合文化交流的情況，有更多的機會進行大量醫(yī)治傷病疾苦的實踐，從而使臨床醫(yī)學迅速發(fā)展，各科臨證經(jīng)驗進一步充實。診斷水平明顯提高，治法豐富多采，診治均有新的創(chuàng)造和發(fā)現(xiàn)。據(jù)記載，本時期問世的醫(yī)方書籍近200種，在內(nèi)科、外科、骨傷科、婦兒科以及各種急救處理等方面，均有很大進步。
（二)診斷學和針灸學的基礎理論和實踐規(guī)范化，在總結(jié)整理前代成就的基礎上，有重大發(fā)展，晉·王叔和的《脈經(jīng)》，魏晉間皇甫謐的《針灸甲乙經(jīng)》等著作為其卓越代表，并對后世產(chǎn)生了深遠影響。
（三)藥物學有突出進步，本時期本草著作達70余種，最有影響的是南北朝時陶弘景的《本草經(jīng)集注》，他將前代本草學成就進行了較徹底的整理，又總結(jié)《本經(jīng)》后數(shù)百年的新經(jīng)驗，參考《名醫(yī)別錄》和本人研究心得著成此書，不但藥物品種成倍增加，對藥物限制、度量衡、劑型等嚴加考訂，更重要的是開創(chuàng)了新的本草分類方法，影響深遠。雷敩所撰《雷公炮炙論》是我國現(xiàn)知藥物炮炙的最早專著。
（四)在玄學思想影響下，服石之風大盛，并使煉丹術迅速發(fā)展，由此既引起許多新的疾病的產(chǎn)生，也推動了藥物學的發(fā)展，這是本時期醫(yī)藥學另一個顯著特點。
