（一)合成原料
自然界由mRNA編碼的氨基酸共有20種，只有這些氨基酸能夠作為蛋白質(zhì)生物合成的直接原料。某些蛋白質(zhì)分子還含有羥脯氨酸、羥賴氨酸、γ-羧基谷氨酸等，這些特殊氨基酸是在肽鏈合成后的加工修飾過程中形成的。
�。ǘ�)mRNA是合成蛋白質(zhì)的直接模板
原核細胞中每種mRNA分子常帶有多個功能相關(guān)蛋白質(zhì)的編碼信息，以一種多順反子的形式排列，在翻譯過程中可同時合成幾種蛋白質(zhì)，而真核細胞中，每種mRNA一般只帶有一種蛋白質(zhì)編碼信息，是單順反子的形式。mRNA以它分子中的核苷酸排列順序攜帶從DNA傳遞來的遺傳信息，作為蛋白質(zhì)生物合成的直接模板，決定蛋白質(zhì)分子中的氨基酸排列順序。不同的蛋白質(zhì)有各自不同的mRNA，mRNA除含有編碼區(qū)外，兩端還有非編碼區(qū)。非編碼區(qū)對于mRNA的模板活性是必需的，特別是5’端非編碼區(qū)在蛋白質(zhì)合成中被認為是與核糖體結(jié)合的部位。見圖18-2。
圖18-2 (a)原核生物mRNA)為多順反子
(b)真核生物mRNA為單順反子
mRNA分子上以5'→3'方向,從AUG開始每三個連續(xù)的核苷酸組成一個密碼子,mRNA中的四種堿基可以組成64種密碼子。這些密碼不僅代表了20種氨基酸，還決定了翻譯過程的起始與終止位置。每種氨基酸至少有一種密碼子，最多的有6種密碼子。從對遺傳密碼性質(zhì)的推論到?jīng)Q定各個密碼子的含義，進而全部闡明遺傳密碼，是科學(xué)上最杰出的成就之一，科學(xué)家們設(shè)計了十分出色的遺傳學(xué)和生物化學(xué)實驗，于1966年編排出了遺傳密碼字典。見表18-1。
表18-1 氨基酸的密碼（code)
| 5’末端（第1位堿基) |
中間堿基（第二位堿基) |
3’末端（第三位堿基) | |||
| U | C | A | G | ||
| U | 苯丙（Pne)F | 絲(Ser)S | 酪(Tyr)Y | 半胱(Cys)C | U |
| 苯內(nèi)(Pne) | 絲(Ser) | 酪(Tyr) | 半胱(Cys) | C | |
| 亮(Leu)L | 絲(Ser) | 終止信號 | 終止信號 | A | |
| 亮(Leu) | 絲(Ser) | 終止信號 | 色(Trp) | G | |
| C | 亮(Leu) | 脯（Pro)P | 組（His)H | 精（Arg)R | U |
| 亮(Leu) | 脯（Pro) | 組（His) | 精（Arg) | C | |
| 亮(Leu) | 脯（Pro) | 谷胺（Gin)Q | 精（Arg) | A | |
| 亮(Leu) | 脯（Pro) | 谷胺（Gin) | 精（Arg) | G | |
| A | |||||
| 異亮（ILe)I | 蘇（Thr)T | 天胺（Asn)N | 絲(Ser)S | U | |
| 異亮（ILe) | 蘇（Thr) | 天胺（Asn) | 絲(Ser) | C | |
| 異亮（ILe) | 蘇（Thr) | 賴（Lys)K | 精（Arg)R | A | |
| *蛋（Met)M(起動信號) | 蘇（Thr) | 賴（Lys) | 精（Arg) | G | |
| G | |||||
| 纈（Val)V | 丙（Ala)A | 天（Asp)D | 甘（Gly)G | U | |
| 纈（Val) | 丙（Ala) | 天（Asp) | 甘（Gly) | C | |
| 纈（Val) | 丙（Ala) | 谷（Glu)E | 甘（Gly) | A | |
| 纈（Val) | 丙（Ala) | 谷（Glu) | 甘（Gly) | G | |
*位于mRNA起動部位AUG為氨基酸合成肽鏈的起動信號。以哺乳動物為代表的真核生物，此密碼子代表蛋氨酸；以微生物為代表的原核生物則代表甲酰蛋氨酸。
遺傳密碼具有以下幾種特點：
（1)起始碼與終止碼（Initiation codon and termination codon):
密碼子AUG是起始密碼，代表合成肽鏈的第一個氨基酸的位置，它們位于mRNA5′末端，同時它也是蛋氨酸的密碼子，因此原核生物和真核生物多肽鏈合成的第一個氨基酸都是蛋氨酸，當然少數(shù)細菌中也用GUG做為起始碼。在真核生物CUG偶爾也用作起始蛋氨酸的密碼。密碼子UAA，UAG，UGA是肽鏈成的終止密碼，不代表任何氨基酸，它們單獨或共同存在于mRNA3’末端。因此翻譯是沿著mRNA分子5′→3′方向進行的。
�。�2)密碼無標點符號：兩個密碼子之間沒有任何核苷酸隔天，因此從起始碼AUG開始，三個堿基代有一個氨基酸，這就構(gòu)成了一個連續(xù)不斷的讀框，直至終止碼。如果在讀框中間插入或缺失一個堿基就會造成移碼突變，引起突變位點下游氨基排列的錯誤。醫(yī)學(xué)全在線www.med126.com
（3)密碼的簡并性（Degemeracy)：
一種氨基酸有幾組密碼子，或者幾組密碼子代表一種氨基酸的現(xiàn)象稱為密碼子的簡并性，這種簡并性主要是由于密碼子的第三個堿基發(fā)生擺動現(xiàn)象形成的，也就是說密碼子的專一性主要由前兩個堿基決定，即使第三個堿基發(fā)生突變也能翻譯出正確的氨基酸，這對于保證物種的穩(wěn)定性有一定意義。如：GCU，GCC，GCA，GCG都代表丙氨酸。
�。�4)密碼的通用性：
大量的事實證明生命世界從低等到高等，都使用一套密碼，也就是說遺傳密碼在很長的進化時期中保持不變。因此這張密碼表是生物界通用的。然而，出乎人們預(yù)料的是，真核生物線粒體的密碼子有許多不同于通用密碼，例如人線粒體中，UGA不是終止碼，而是色氨酸的密碼子，AGA，AGG不是精氨酸的密碼子，而是終止密碼子，加上通用密碼中的UAA和UAG，線粒體中共有四組終止碼。內(nèi)部甲硫氨酸密碼子有兩個，即AUG和AUA；而起始甲硫氨酸密碼子有四組，即AUN。
密碼子結(jié)構(gòu)與氨基酸側(cè)鏈析性之間也有一定關(guān)系。①氨基酸側(cè)鏈極性性質(zhì)在多數(shù)情況下由斷面子的第二個堿基決定。第二個堿基為嘧啶（Y)時，氨基酸側(cè)鏈為非極性，第二個堿基為嘌呤時，氨基酸側(cè)鏈則有極性。②當?shù)谝粋�堿基為U或A，第二個堿基為C，第三個堿基無特異性時，所決定的氨基酸側(cè)鏈為極性不帶電。③當?shù)谝粋�堿基不是U，第二個堿基是P時，氨基酸側(cè)鏈則帶電。在此前提下，若是一個是C或A時，表示帶正電的氨基酸，第一、二個堿基分別是G、A時，此種氨革酸帶負電，但上述關(guān)系也有個別例外。
一種氨基酸由多種密碼子所編碼的事實使人想到：同一種氨基酸的一組密碼子的使用頻率是否相同？許多實驗證實，在原核生物和高等真核生物中同一組密碼子的使用頻率是不相同的。高頻密碼子多出現(xiàn)在那些表達量高的蛋白質(zhì)基因中，例如，核糖體蛋白質(zhì)基因，RecA蛋白質(zhì)基因等。表18-2。這種使用頻率與細胞內(nèi)一組tRNA中的不同tRNA含量有關(guān)。
